根據其結構和配置，有兩種不同類型（A型和B型）。
它們根據排出的空氣與從普通空氣室再循環的空氣的百分比進行分類。此外，機柜具有不同的排氣裝置，其中一些可以將空氣直接排放回實驗室，而其他裝置可以通過管道系統將空氣排放到外部通風系統。
A型機柜適用于微生物研究，不含任何揮發性或有毒化學物質，因為空氣在機柜內再循環。該機柜類型進一步分為A1和A2類型。
A1生物安全柜
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HEPA過濾下流。
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70％的空氣在機柜內再循環。
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30％的HEPA過濾空氣被排放到實驗室或外部大氣中。
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HEPA過濾后的空氣可通過頂針式管道連接排回實驗室或外部大氣。
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或者具有生物污染的正壓通風系統。
A2生物安全柜
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HEPA過濾下流。
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70％的空氣在機柜內再循環。
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30％的HEPA過濾空氣通過頂針管連接排回實驗室或外部大氣。
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生物污染的壓力通風系統處于負壓或被負壓包圍。
B型機柜硬排到建筑物排氣系統并包含負壓增壓室，并進一步分為B1和B2型。
B1生物安全柜
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HEPA過濾下流。
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30％的空氣在機柜內再循環。
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70％的HEPA過濾空氣被排放到外部通風系統。
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必須將機柜硬管道插入外部通風系統。
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在負壓下可能有生物污染的管道和壓力通風系統。
B2生物安全柜
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HEPA過濾下流。
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沒有空氣在機柜或工作區域內再循環。
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100％的HEPA過濾空氣從機柜中排出。
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必須將機柜硬管道插入外部通風系統。
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所有管道和壓力通風都處于負壓狀態。
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所有受污染的管道都處于負壓下或被直接排出的負壓管道或壓力通風系統包圍。
